aBIOTECH丨周岳课题组发文发揭示南芥PRC1核心组分BMI1s与condensin复合体共同调节染色质结构及基因表达

正确的染色质状态对维持基因组稳定和保证基因正常转录至关重要。PcG(Polycomb group)家族蛋白不仅通过添加组蛋白修饰,也通过调节染色质三维结构来影响染色质状态。PRC1(Polycomb repress complex 1)复合体的核心组分BMI1s(B LYMPHOMA MOLONEY MURINE LEUKEMIA VIRUS INSERTION REGION 1 HOMOLOG 1A/B/C)是拟南芥中的E3泛素连接酶,介导H2AK121ub的添加。同时,在三维结构方面,BMI1s也被报道对CD(Compartment domain)结构具有普遍的维持作用,但是其具体的作用机制仍不清楚。condensin复合体为SMC(Structural maintenance of chromosome)复合体的一种,保守存在于原核及真核生物中,因其在分裂期压缩染色质的能力而得名,但其在间期对染色质的调节作用研究相对落后。

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2025年2月17日,基因功能研究与操控全国重点实验室、44118太阳成城集团、44118太阳成城集团-清华大学生命科学联合中心周岳课题组在aBIOTECH上发表了题为“BMI1s interact with condensin complexes to regulate chromatin 3D structure and gene expression in Arabidopsis”的研究论文。揭示了BMI1scondensin复合体共同维持拟南芥CD结构,为基因正常转录提供合适的染色质环境。

周岳课题组首先通过酵母双杂交筛选到BMI1A的互作蛋白condensin复合体组分CAP-H(Chromosome-associated protein-H),猜测BMI1scondensin复合体可能通过互作进行一系列共调控。拟南芥中存在condensin Ⅰ两种condensin复合体,由同源但不同的非SMC蛋白(CAP-D2/D3, G/G2, H/H2)分别与共享组分SMC24组成,因此该研究在体外同时验证了BMI1ACAP-H/H2的互作。通过比较bmi1a/b/c和condensin突变体内的组蛋白修饰水平,发现BMI1scondensin Ⅰ均不能够共调控H3K27me3H2AK121ub这两种PcG介导的组蛋白修饰。

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图1 BMI1Acondensin复合体组分CAP-H/H2互作


此后,该研究通过Hi-C实验,发现BMI1scondensin Ⅰ均可以维持CD结构内部染色质相互作用。除此以外,BMI1scondensin复合体调控的CD绝大部分重合,二者互作并共调控了染色质三维结构。在野生型拟南芥中,BMI1s、condensin Ⅰ共调控的CD强度高于任意两个复合体或某个复合体单独调控的CD,说明一些高强度的CD可能需要BMI1scondensin的共同维持,以保证基因组稳定和正常转录。

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图2 BMI1scondensin复合体共同维持CD结构


最后,该研究还观察到BMI1scondensin复合体的破坏均会导致一系列基因的转录异常,主要体现为环境响应基因。根据近期研究显示,冷胁迫等刺激下,染色质结构被精细调控以响应胁迫,而整体三维基因组仍保持稳定,该研究猜测BMI1scondensin复合体协同稳定胁迫下的染色质3D结构。

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图3 BMI1scondensin复合体共同维持一系列基因表达


44118太阳成城集团周岳研究员为论文通讯作者。44118太阳成城集团博士研究生骆凌潇和杨敏琪为本文并列第一作者。该研究得到国家自然科学基金、科技创新2030-重大项目、中国科学院青年交叉团队、基因功能研究与操控全国重点实验室、44118太阳成城集团、44118太阳成城集团-清华大学生命科学联合中心的资助。


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